广州到厦门的火车经过的站点包括两种可能性，一种是经由南昌，另一种是经由福州。
如果选择经南昌的路线，从广州出发的列车会经过河源、龙川、惠州、深圳北、龙岗、坂田、东莞、樟木头、常平、虎门、南昌、九江、上饶、武夷山、南平等站点，然后到达终点站厦门。其中，南昌是该路线的重点站点，乘客可在此站乘坐其他火车转车前往其它目的地。
如果选择经福州的路线，从广州出发的列车则会途经肇庆、梅州、潮州、汕头、榕城、揭阳、晋江、泉州、莆田等站点，最后到达终点站厦门。其中，福州是该路线的重点站点，同样也是乘客转车的地点。
无论选择哪条路线，途中都会经过多个站点，让乘客可以欣赏到不同地区的风景与文化，同时还可选择在中途下车游玩或换乘其他列车前往周边城市旅游。
