1、地理位置不同：
上海站位于上海市静安区秣陵路，毗邻上海长途客运总站，是上海铁路枢纽的重要组成部分。
上海南站位于上海市徐汇区沪闵路，是中国铁路上海局集团有限公司管辖的客货特等站，是上海铁路客运南大门，是上海铁路枢纽1、地理位置不同：
2、主要线路不同：
上海站主要线路是京沪铁路、沪昆铁路、沪宁城际铁路。
上海南站主要线路是沪杭铁路、京沪铁路、金山铁路。
3、投用时间不同：
上海站投用日期是1908年。
上海南站投用日期是2006年7月1日
火车运行不同
上海站绿皮车少
班次情况：高铁班次有213个班次，如G7220、G13、G7027、G7094、G7288等；动车班次有30个班次，如D5466、D4216、D2921、D706、D2922等；城际班次有36个班次，如C3812、C3818、C3856、C462、C464等；
上海南站绿皮车多
班次情况：直达特快列车有8个班次，如Z27、Z245、Z247、Z257、Z284等；特快列车有18个班次，如T212、T81、T135、T869、T871等；快速旅客列车有74个班次，如K527、K1512、K50、K469、K512等
1、上海站是主站，全国各地的火车都有。上海南站是南面的车多，而且多是短途的车。车票上会注明（上海南站）字样。
2、上海站，位于上海市静安区秣陵路303号。上海火车站位于上海闸北区，是上海客流量最大的火车站，也是上海轨道交通的站名。上海市民通常称之为“新客站”，以区别老的上海火车站（即老北站）。上海站主要是去往西和北的列车，既有高铁、动车，又有牵引列车。
