东莞南城距离最近的高铁站是虎门站，
距离最近的城际火车站是东莞站，
虎门站可以从南城做地铁直达。虎门站是一座地面站房兼高架站台的铁路车站，共有三层，采用下进下出与南北进出相结合的乘车方式。车站地面一层是售票厅，地上二层是站厅层，主要为候车区，配套有店铺。西南侧预留与地铁站互通平台，三层地上层是站台层。
东莞虎门高铁站
离东莞东城最近的高铁站是东莞虎门（高铁）站，出站乘坐R2地铁，直达东城。
另外；
2021年12月10日，东莞南（塘厦）站已开通，是东莞市境内最靠近深圳的铁路车站，从东莞南站乘车到深圳北站只需15分钟，是赣深高铁在东莞的唯一站点。
