1.车站地址不同。
昆明南站位于昆明市呈贡区吴家营街道白龙潭山脚之西。
昆明站位于昆明市官渡区北京路1号。
2.车站规模不同。
昆明南站总建筑面积为33.47万平方米，站台规模16台30线。
昆明站总建筑面积25000平方米，站台规模9台14线。
3.主要线路不同。
昆明南站主要运送线路为沪昆高速铁路，南昆高速铁路，昆玉城际铁路。
昆明站主要运输线路为沪昆铁路，成昆铁路，南昆铁路。
昆明站主要运行K，T，Z开头的普通列车以及云南省内的动车。
昆明南站是高铁站，主要运行高铁列车。
昆明站是老火车站，昆明南站是高铁站，昆明南站可以坐地铁到昆明各个市区，南站在呈贡新区，昆明站在北京路上，在市区，
