第一，速度不同
通常来说，高铁和动车在速度上不同，通常来说，高铁平均速度在520㎞/h左右，而动车平均速度在200㎞/h。对于铁路部门来说，当然是速度快，收费就要高一些了。
第二，轨道造价高
对于现在的高铁来说，速度越来越快，所以对轨道的要求越来越高，现在高铁轨道全程上千公里基本都是采取无缝连接，所以相对来说造价也要高出很多。而动车在一般的普通列车轨道上也能正常运转。
第三，车体成本高
高铁的材料更先进。对于高铁来说，由于速度很快，在通过隧道或者高速运行时候，内外会形成较大的压强差，所以对安全性要求更高，所以无论是对挡风玻璃还是车体要求都更高。虽然起始终到站点相同，但是高铁和动车的行车路线可能不同，高铁距离远，但速度快（300km/h），动车距离短，但速度慢（200km/h），距离长自然价格贵。例如成都到重庆经由成渝客专（高铁）和宁蓉线（动车），杭州到福州经由沪昆高铁、合福高铁（高铁）和经由杭福深快铁（动车）
高铁在客运专线上可以跑到300km/h，复兴号甚至可以跑到350km/h，而动车即使在客运专线也只能跑到250km/h，快速铁路和其他大多数路段只能跑到200km/h。速度快了，耗电量自然大，进而价格也就贵了。
高铁使用的都是CRH380系列和CR400系列（复兴号），这类车本身造价就高，故票价会更高
