东莞目前共有4个主要铁路客运站，以及12个城际铁路车站：
东莞站：石龙镇与茶山镇交界处，可乘坐 广深城际动车、广潮(汕)动车和 部分普通列车，可乘坐 地铁2号线 前往东莞各镇街；
东莞东站：位于常平镇，可乘坐 部分 全国各线普通列车，可换乘 莞惠城际 前往 东莞各镇街 及 惠州市各站；
虎门站：位于虎门镇，可乘坐全国各线G字头高速列车、香港特区G字头高速列车，可乘坐 地铁2号线 前往东莞各镇街；
常平站：位于常平镇，可乘坐广深城际动车、广潮(汕)动车、穗港直通车；
〈莞惠城际铁路〉
2017年12月全线通车，沿线各站可经此线前往 东莞西站(2019年9月开通) 换乘 穗莞深城际列车，前往 常平东站(东莞东站)换乘全国各线普通列车，前往小金口站(惠州站)换乘全国各线普通列车。
东莞西站(望洪枢纽站)(2019年9月开通)：望牛墩镇与洪梅镇交界处，可乘坐 莞惠城际、佛莞城际(在建)、穗莞深城际(在建)列车；
道滘站：位于道滘镇，可乘坐莞惠城际列车；
西平西站：位于东莞南城西平街道，可乘坐莞惠城际列车，可换乘 地铁2号线 前往东莞各镇街；
东城南站：位于东城与南城交界处，东华高级中学旁，可乘坐莞惠城际列车；
寮步站：位于寮步镇，可乘坐莞惠城际列车；
松山湖北站：位于松山湖，可乘坐莞惠城际列车；
大朗镇站：位于大朗镇，可乘坐莞惠城际列车；
常平南站：位于常平镇，可乘坐莞惠城际列车；
常平东站：位于常平镇，东莞东站对面，可乘坐莞惠城际列车，可换乘全国各线普通列车；
樟木头东站：位于樟木头镇，可乘坐莞惠城际列车；
银屏站：位于谢岗镇，可乘坐莞惠城际列车；
〈广深城际铁路〉
东莞站
常平站
樟木头站：位于樟木头镇，可乘坐 广深城际动车 前往广深各地。
〈广深港高速铁路〉
虎门站
〈穗莞深城际铁路〉
预计将于2019年9月通车
〈莞佛城际铁路〉
预计将于2020年通车
〈赣深高速铁路〉
预计将于2021年通车
